El nuevo Informe sobre transparencia de las Universidades Españolas 2016 elaborado por la Fundación Compromiso y Transparencia, la Universidad de Zaragoza no figura en el grupo de las 26 Universidades Transparentes.
Al contrario, se le otorga la calificación de 25 puntos lo que le supone la calificación de UNIVERSIDAD TRANSLÚCIDA, porque pese a cumplir 20 o más indicadores (criterio cuantitativo) no cumplen el criterio cualitativo: publicar los estados financieros y el informe de auditoría correspondiente al ejercicio económico 2016.